Po pojawieniu się wszechmocnego Kishina kraina Hinomoto została zdominowana przez demony zwane Oni. Musashi wraz ze swoim przyjacielem Kojiro wyruszają z rodzinnego miasta, chcąc stworzyć najsilniejszy klan Bushi. Po spotkaniu Hattori Tsugumi cała trójka stworzyła grupę Kanemaki. Gdy Musashiemu udaje się zdobyć swój miecz Kitetsu, robią pierwszy wielki krok w kierunku spełnienia swojego marzenia. W porcie Harima grupa Musashiego spotka się z potężnym klanem Bushi – Uesugi, któremu dowodzi Uesugi Tatsuomi. Stworzyli oni sojusz, by wspólnie zabić gigantycznego Kishina - Yamata no Orochi, który zawładnął całą wyspą Awaji. Do sojuszu dołącza również klan Bushi „Takeda”, którego kapitanem jest Takeda Naotora, a także kilku innych Bushi w podobnym wieku co Musashi, jak Shimazu Akihiro i Amako Katsumi lub też nieśmiała księżniczka Saruwatari Michiru. Musashi i jego przyjaciele dołączają do polowania na Kishinów oraz niepokonanego Boga demonów – Yamato no Orochi. I tak rozpoczyna się wielka bitwa o wyspę Awaji!